Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RAP15509 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RAP15509 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms