Protein–RNA interactions for Protein: P13985

HRES1, Putative HTLV-1-related endogenous sequence, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRES1P13985 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HRES1P13985 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms