Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXD8P13378 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD8P13378 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms