Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNB1P11230 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHRNB1P11230 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms