Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RGPD1P0DJD0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms