Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NGFRP08138 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NGFRP08138 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NGFRP08138 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NGFRP08138 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms