Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSCO60682 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSCO60682 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSCO60682 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSCO60682 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSCO60682 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSCO60682 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSCO60682 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSCO60682 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSCO60682 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSCO60682 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSCO60682 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSCO60682 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSCO60682 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms