Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOCS3O14543 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms