Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFIBO00712 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFIBO00712 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFIBO00712 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFIBO00712 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIBO00712 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIBO00712 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIBO00712 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFIBO00712 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIBO00712 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIBO00712 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIBO00712 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFIBO00712 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFIBO00712 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms