Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2CD4DB7Z1M9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2CD4DB7Z1M9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms