Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XIRP2A4UGR9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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