Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX11Q9Y6N1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX11Q9Y6N1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms