Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HECTD4Q9Y4D8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms