Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9Y3F1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9Y3F1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms