Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC8Q9Y2L5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms