Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUDCQ9Y266 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
NUDCQ9Y266 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms