Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZMYND8Q9ULU4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZMYND8Q9ULU4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms