Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND2AQ9ULE3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms