Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPRSS11EQ9UL52 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms