Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCTN4Q9UJW0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms