Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBE1Q9UJT0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBE1Q9UJT0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms