Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLKQ9UBT6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLKQ9UBT6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLKQ9UBT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms