Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNRD1Q9P1U0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms