Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSD3Q9NYI0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms