Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPMQ9NSP4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CENPMQ9NSP4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms