Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF275Q9NSD4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms