Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPNPEP3Q9NQH7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms