Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUFT1Q9NNX1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms