Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRMS1Q9HCU9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRMS1Q9HCU9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms