Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNMDQ9H2S6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNMDQ9H2S6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms