Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NIF3L1Q9GZT8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms