Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD7BQ9C0I4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD7BQ9C0I4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms