Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM4Q9C037 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM4Q9C037 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms