Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPF3BQ9BZI7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UPF3BQ9BZI7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms