Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAP1Q9BWH6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAP1Q9BWH6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms