Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR3CQ9BUI4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3CQ9BUI4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms