Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NICN1Q9BSH3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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