Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHOXF2Q9BQY4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOXF2Q9BQY4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms