Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GORASP1Q9BQQ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms