Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HINFPQ9BQA5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HINFPQ9BQA5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms