Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGRRF1Q99675 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CGRRF1Q99675 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms