Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD9AQ99638 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms