Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C8orf49Q96NF6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C8orf49Q96NF6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms