Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00167Q96N53 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00167Q96N53 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms