Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YTHDC1Q96MU7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
YTHDC1Q96MU7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YTHDC1Q96MU7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
YTHDC1Q96MU7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YTHDC1Q96MU7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
YTHDC1Q96MU7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
YTHDC1Q96MU7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
YTHDC1Q96MU7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms