Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A4AQ96JQ5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A4AQ96JQ5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms