Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GCC1Q96CN9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCC1Q96CN9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms