Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSUN4Q96CB9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms