Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RUNDC1Q96C34 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RUNDC1Q96C34 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms