Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFT1Q96AA3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms